近年來雖然全世界海水淡化產(chǎn)業(yè)發(fā)展很快，但我國社會各界對海水淡化的重要性還存在誤區(qū)，尤其在解決沿海地區(qū)和海島水資源短缺問題方面對海水淡化的重要性認(rèn)識尚淺，社會上普遍認(rèn)為海水淡化是一種高成本的科研新技術(shù)，對海水淡化水作為飲用水、海水淡化濃鹽水對環(huán)境的影響等問題還存在著疑慮，對福州海水淡化作為優(yōu)化水資源配置的重要措施缺乏科學(xué)判斷和認(rèn)同感。

　　管理問題

　　目前分管水資源、海水淡化及新興產(chǎn)業(yè)的水利部、海洋局、發(fā)改委等政府主管部門之間在海水淡化各個(gè)環(huán)節(jié)職責(zé)分工不夠清晰，部門之間沒有很好的銜接，致使各級水行政主管部門未能充分履行和發(fā)揮其在海水淡化與管理過程中應(yīng)有的職責(zé)和作用。此外，由于體制和條塊分割等問題，水行政主管部門也未參與海水淡化工程的建設(shè)計(jì)劃全過程，致使海水淡化工程未能充分實(shí)現(xiàn)其利用效率和效益。

　　研發(fā)資金投入不足，缺乏公共的科研和創(chuàng)新平臺。我國海水淡化技術(shù)是在國家重點(diǎn)攻關(guān)項(xiàng)目和政府支持下推動(dòng)發(fā)展起來的，與技術(shù)先進(jìn)的國家相比，研發(fā)資金投入相對較少。